IBiS

Áreas de trabajo

La línea general de investigación del grupo es el estudio de la respuesta inmunitaria en distintos escenarios. Más concretamente, nuestro trabajo se dirige al estudio de:

1) Los mecanismos de rechazo que se producen en respuesta al reconocimiento alogénico en el contexto del trasplante de órganos sólidos, así como en el desarrollo de la enfermedad de injerto contra huésped tras el trasplante de progenitores hematopoyéticos. Hemos descrito dos sistemas menores de incompatibilidad cuya incompatibilidad entre el donante y el receptor desencadenan una respuesta inmunológica muy específica de consecuencias graves para el receptor del trasplante. Se han caracterizado los anticuerpos que reconocen la glutatión S-transferasa T1 (GSTT1) con objeto de averiguar si son fijadores de complemento. Más recientemente, se ha comenzado una línea para  analizar la presencia de linfocitos T específicos en células de los pacientes. Hemos encontrado linfocitos T que se activan rápidamente cuando son estimulados bien por péptidos de la GSTT1  o por moléculas artificiales cargadas con estos péptidos (pentámeros y tetrámeros). El principal objetivo es demostrar cuales son los mecanismos por los que se produce el daño al injerto.

2) Los procesos de homeostasis e inmunoregulación en pacientes inmunocomprometidos con el objetivo de definir el papel de los mismos en situaciones clínicas que cursan con linfopenia T y/o inflamación y/o inmunosenescencia. Esta línea de trabajo se centra en los procesos de homeostasis de células T centrales (función tímica, principalmente) y periféricos (distintos mecanismos de proliferación homeostática compensatoria). Hemos desarrollado un sistema de co-cultivo celular para estudiar los mecanismos de proliferación homeostática en células T humanas, cuya explotación podría tener aplicación terapéutica. Nuestras últimas investigaciones indican que los procesos homeostáticos tienen un papel crítico en situaciones clínicas que cursan con linfocitopenia, estando estrechamente relacionados con la inflamación sistémica y con alteraciones de la regulación inmunitaria. Durante los últimos años, los escenarios de estudio principales han sido el escenario del “aging” o envejecimiento (colaboramos activamente con residencias de mayores para la obtención de muestras) y el escenario de la infección por VIH (colaboramos activamente en la Red Nacional de Investigación en SIDA (RIS)). Pero esta línea de trabajo es fácilmente extrapolable a la situación de inmunosupresión en trasplantes y en patología autoinmune y/o autoinflamatoria. Tenemos amplia experiencia en el estudio fenotípico y funcional de linfocitos T, incluyendo las células T reguladoras (Treg), no solo a nivel periférico sino también a nivel de mucosa linfoide. Tenemos experiencia sobre todo en tejido linfoide asociado a intestino (GALT) y, en esta localización, estamos especialmente interesados en explorar la interacción entre sistema inmunológico y microbioma, en relación a los procesos de homeostasis. Una línea emergente de trabajo es el estudio del inmunometabolismo de las células T durante los procesos de homeostasis, con el fin de explorar potenciales aplicaciones terapéuticas.

3) Las rutas moleculares que conducen al desarrollo de enfermedades de base inflamatoria.  En esta línea, nos hemos centrado en los últimos años en el estudio de genes relacionados con la artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, enfermedad de Chron y de Behcet, así como, en la infección por virus de hepatitis C. Tradicionalmente, hemos utilizado abordaje de estudio de genes candidatos en base a la función de las moléculas que codifican con estudios de bajo rendimiento (PCR convencional y PCR a tiempo real). En nuestros proyectos más recientes, hemos introducido el uso de plataformas de rendimiento medio (Sequenom iPlex MassARRAY) y alto (Immunochip) que nos han permitido estudiar de manera simultánea gran cantidad de polimorfismos localizados en genes relacionados con los sensores de ácidos nucleicos y realizar un escrutinio exhaustivo de un gran número de variantes localizadas en genes  relacionados con el sistema inmune. Por último, hemos introducido el uso de Next Generation Sequencing (NGS) para el estudio de variantes raras. Estudios de este tipo han permitido comprobar la existencia de rutas comunes a diferentes patologías inmuno-mediadas. Actualmente, nos encontramos desarrollando estudios funcionales que nos permitan establecer relaciones fenotipo/genotipo en modelos in vitro.

En cuanto a las herramientas utilizadas en nuestro laboratorio, tenemos experiencia en cultivos primarios de linfocitos, estudios de fenotipo y función de linfocitos T, aislamiento y análisis de subpoblaciones inmunológicas en mucosa linfoide intestinal, rastreo de genotecas de expresión, estudio de anticuerpos, inmunohistoquímica e inmunocitoquímica, cuantificación celular en biopsia, uso de diferentes plataformas de genotipado de pequeña a gran escala, secuenciación Sanger y masiva,  estudios de expresión de RNA.

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