Oncohematología y Genética

Patología molecular de los sarcomas y otros tumores

Consolidado

Cód. SSPA: IBiS-C-11


Trasladado al Instituto en 2013, nuestro grupo de investigación se dedica a abordar los desafíos que presentan los sarcomas, tanto desde una perspectiva clínica como en la comprensión de sus orígenes y mecanismos biológicos. Los sarcomas son neoplasias raras y altamente diversas, tanto biológica como clínicamente, y nuestro trabajo se centra en una amplia variedad de estos tumores, con un enfoque especial en el sarcoma de Ewing.


Una de nuestras principales actividades es el desarrollo de nuevos modelos experimentales en colaboración con el biobanco, incluyendo modelos celulares y animales. Nos esforzamos por abordar aspectos biológicos críticos de relevancia clínica, como el proceso de metástasis en los sarcomas, que representa uno de los mayores desafíos terapéuticos. Además, trabajamos intensamente en la identificación y validación de nuevas dianas terapéuticas, con el objetivo de mejorar la supervivencia de los pacientes con sarcomas. En esta línea, hace dos años lanzamos un proyecto innovador enfocado en la inmunoterapia adoptiva para el sarcoma de Ewing.


Finalmente, nuestro grupo también se dedica a mejorar las herramientas de diagnóstico para los sarcomas, abarcando tanto los tumores sólidos como la detección de biomarcadores circulantes. Nuestro objetivo es validar clínicamente estas herramientas para su integración en la rutina diagnóstica del Sistema Nacional de Salud.



Líneas de Investigación:


  • Evolución molecular del glioblastoma e identificación de nuevas dianas terapéuticas. Proyecto financiado por la Junta de Andalucía. PECART-0007-2026


El proyecto estudia los cambios moleculares que se producen durante la aparición y progresión del glioblastoma. Para ello, utiliza un modelo experimental que reproduce distintas etapas de la transformación de células madre neurales hasta la adquisición de un fenotipo tumoral más agresivo. El trabajo combina el análisis de datos de RNA-seq con estudios funcionales y técnicas de transcriptómica unicelular, epigenómica y proteómica. Los resultados se comparan con datos y muestras de pacientes para determinar qué alteraciones se conservan en el glioblastoma humano e identificar nuevas dianas con posible interés terapéutico.



  • Proyecto SARCOMATRYX: Nuevas Terapias en Sarcomas - Proyecto CPP2022-009791 financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/PRTR.


El proyecto SARCOMATRYX se centra en el desarrollo terapéutico para sarcomas agresivos, como los leiomiosarcomas y sarcomas pleomórficos indiferenciados, utilizando la proteína FAP como objetivo terapéutico. El proyecto busca identificar subtipos de sarcoma aptos para el tratamiento con OMTX705, un inmunoconjugado que ha demostrado eficacia preclínica. La colaboración entre ONCOMATRYX y FISEVI combina experiencia en biomarcadores y recursos técnicos, con el objetivo de impactar positivamente en la vida de los pacientes y generar beneficios económicos a través de licencias farmacéuticas.


Este proyecto se enmarca y cuenta con el respaldo del MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN COLABORACIÓN PÚBLICO PRIVADA 2022.




  • Proyecto FIS PI23: Explorando Vulnerabilidades en el Sarcoma de Ewing


Este proyecto busca comprender por qué algunos pacientes con sarcoma de Ewing responden de manera diferente a los agentes genotóxicos y a los inhibidores de la respuesta al daño del ADN. Utilizando un cribado CRISPR y análisis de variantes genómicas, se investigarán los mecanismos de sensibilidad al daño del ADN y se evaluará la eficacia de terapias combinadas. El objetivo final es desarrollar nuevas terapias y biomarcadores que permitan identificar a los pacientes más adecuados para estos tratamientos.



  • Caracterización Molecular del Sarcoma de Ewing


Esta línea de investigación se enfoca en la caracterización molecular del sarcoma de Ewing, analizando las alteraciones genéticas y su impacto en la progresión tumoral. Se utilizan técnicas avanzadas, como secuenciación específica y análisis de RNA-seq, para definir perfiles transcripcionales y de metilación, buscando establecer un patrón que ayude en la comprensión y tratamiento de esta enfermedad en pacientes jóvenes.



  • Proyecto FIS PI22: Mejorando Diagnósticos Moleculares Basados en Inestabilidad Genómica


Esta línea se enfoca en el diagnóstico de sarcomas indiferenciados de células pequeñas y redondas (USRCS), utilizando la inestabilidad genómica como herramienta para la medicina de precisión. Se busca identificar variantes estructurales genómicas (SVs) que impacten en la clínica de la enfermedad, utilizando tecnologías citogenéticas avanzadas y RNA-seq para evaluar las consecuencias transcriptómicas de estas alteraciones. El objetivo es mejorar la identificación de pacientes en riesgo de recaída y optimizar su tratamiento.



  • Genómica 3D para el diagnóstico de precisión en tumores de hueso y partes blandas, y como aproximación experimental para identificar nuevas vulnerabilidades en el sarcoma de Ewing

 

El proyecto busca optimizar el manejo clínico de sarcomas mediante diagnóstico molecular de precisión basado en SVs (Variantes estructurales genómicas). Se validará e implementará HiC (High throughput Chromatine Conformation Capture) como herramienta citogenómica capaz de detectar SVs a escala genómica en muestras FFPE con mayor sensibilidad que métodos dirigidos, mejorando la clasificación tumoral. Además, se integrarán HiC y técnicas ómicas para caracterizar el remodelado regulador de la cromatina asociado a SVs en sarcoma de Ewing y evaluar genes implicados en oncogénesis y posibles dianas terapéuticas.

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