Cód. SSPA: IBiS-A-12
Las actividades del Grupo están centradas en proyectos relacionados con sus cuatro líneas de investigación:
- Infecciones relacionadas con la asistencia sanitaria y optimización del uso de antimicrobianos
En esta línea se realizan proyectos de formación transversal para mejorar el uso de los antimicrobianos disponibles, mediante nuevas técnicas educativas y la utilización de las nuevas tecnologías de la información, en diferentes niveles sanitarios, y para el control de las infecciones relacionadas con la asistencia sanitaria (IRAS). Al mismo tiempo se realizan ensayos clínicos para generar conocimiento que mejore el uso de los antimicrobianos disponibles, con estudios farmacocinéticos/farmacodinámicos, la evaluación de la duración más adecuada de los tratamientos, y su impacto ecológico.
- Nuevos tratamientos antimicrobianos en infecciones por bacterias multirresistentes
A través de esta línea se evalúan nuevos antimicrobianos para infecciones por bacterias con diferentes mecanismos de resistencia, tales como Acinetobacter baumannii, Staphylococcus aureus, y Enterobacteriaceae (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae) productoras de betalactamasas de espectro extendido y carbapenemasas. Los estudios se realizan con antimicrobianos de uso habitual, para evaluar su actividad sobre bacterias con mecanismos de resistencia prevalentes o su uso en nuevas combinaciones, así como para la evaluación de nuevos antimicrobianos en fase de desarrollo clínico. Los proyectos abarcan estudios clínicos y experimentales, in vitro y en modelos experimentales de infección.
- Infecciones endovasculares, con estudios sobre factores epidemiológicos, aspectos clínicos relevantes, aspectos microbiológicos y manejo terapéutico en su vertiente médica y quirúrgica
Las actividades incluyen la endocarditis infecciosa y las infecciones en dispositivos de estimulación eléctrica cardiaca.
En la línea de optimización del uso de antimicrobianos estamos realizando proyectos encaminados a mejorar el tratamiento de las bacteriemias por Pseudomonas aeruginosa, tanto en cuanto a los mejores tratamientos, como en la menos duración necesaria para su curación. Así, tenemos en curso el proyecto “Estudio prospectivo de bacteriemias por P. aeruginosa en pacientes adultos: eficacia y seguridad de las diferentes estrategias terapéuticas en el entorno actual de multirresistencia”, con desarrollo multicéntrico, en pacientes en adultos incluidos en una cohorte prospectiva hospitalaria, con objetivos de epidemiología molecular, mecanismos de resistencia y factores de virulencia, así como analizar la relación entre la farmacodinamia de los betalactámicos en perfusión extendida y la supervivencia de los pacientes. Igualmente, el grupo lidera un ensayo clínico multicéntrico de superioridad para conocer, por primera vez, el beneficio de tratamientos cortos vs. prolongados (7 vs. 14 días), utilizando un análisis innovador (DOOR/RADAR), analizando recurrencias, efectos adversos, sobreinfecciones, y el posible menor impacto en la microbiota intestinal mediante la amplificación de las regiones V3 and V4 del gen codificante del 16S rRNA y análisis bioinformáticos, al disminuir la exposición a antimicrobianos. Los indicadores propuestos en los últimos años previsiblemente permitirán una mejor evaluación del impacto de las intervenciones en los ámbitos extrahospitalarios. En el desarrollo de nuevos métodos diagnósticos, específicamente mediante herramientas de edición genética (CRISPR/Cas13), con la finalidad de conseguir una técnica de detección precoz de la bacteriemia, de determinantes de virulencia y mecanismos de resistencia en sangre, que pueda implementarse fácilmente en los hospitales, con equipamiento poco complejo, con el propósito de contribuir a la reducción de la morbimortalidad de pacientes con bacteriemia por P. aeruginosa.
La línea para el desarrollo de nuevas alternativas terapéuticas en las infecciones por bacilos gramnegativos multirresistentes estamos trabajando en proyectos colaborativos, para: i) optimizar el tratamiento de las infecciones urinarias por K. pneumoniae, los trasplantados renales con. en base al pH urinario, reduciendo riesgos como el rechazo y la morbimortalidad asociada; ii) desarrollar nuevas estrategias de tratamiento mediante inhibidores de bombas de expulsión y ARN anti-sentido, mediante la evaluación in vivo de tratamientos no antimicrobianos, solos y en combinación con antibióticos frente a infecciones por BGN-MDR, en colaboración con el Dr. Jordi Vila (Hospital Clinic, Barcelona); iii) estudiar in vitro e in vivo combinaciones de antimicrobianos frente a cepas de P. aeruginosa productoras de carbapenemasas, en colaboración con el Dr. Antonio Oliver (Hospital Son Espases, Mallorca); iv) evaluar la respuesta inmune específica frente infecciones por bacilos gramnegativos multirresistentes para diseñar y evaluar inmunoterapias pasivas, humoral y celular, in vitro e in vivo como coadyuvante a los antimicrobianos.
En la colaboración consolidada con el Dr. Antonio P. Pulido (UPO, Sevilla) desarrollaremos un estudio computacional en más de 2000 cepas de A. baumannii, en el que recientemente hemos identificado una isla genómica relacionada con sistemas CRISPR/cas, que pudiera tener relación con el uso elevado de antibióticos; nuestro grupo confirmará estos resultados mediante la generación de células knock-out, estudios moleculares y en modelos de infección experimental.
Las resistencias microbianas trascienden la esfera de la patología infecciosa en humanos. La interacción entre el consumo y difusión de antibióticos entre humanos, animales y medio ambiente es de tal importancia, que la continuidad de la línea de investigación sobre optimización del uso de los antimicrobianos y resistencias microbianas necesita aumentar el conocimiento y la evidencia bajo el enfoque One Health. En este respecto, lideramos el WP de una propuesta enviada a la convocatoria “JPI-AMR ACTION Joint Transnational Call for Proposals 2021” para reducir el desarrollo y la transmisión de la resistencia a los antimicrobianos en el ámbito hospitalario, en la que participan investigadores de Noruega, Sudáfrica y Moldavia. Además, estamos diseñando proyectos sobre la monitorización de antibióticos, bacterias resistentes y genes de resistencia en centros sanitarios, en sus efluentes, aguas residuales y de consumo, y en el suelo. La educación es fundamental para alcanzar el cambio conductual hacia un mejor uso de los antimicrobianos, por lo que también pretendemos llevar a cabo ensayos para el diseño, implantación e impacto de intervenciones educativas en la comunidad y en profesionales de la sanidad que sean sostenibles en el tiempo.
Continuamos con el estudio de la evolución del uso de los antimicrobianos en el entorno hospitalario, de Atención Primaria y centros socio-sanitarios, y sus cambios derivados de la pandemia causada por el SARS-CoV-2, y sus posibles efectos sobre la ecología de las bacterias resistentes. Actualmente estamos en fase de análisis de un ensayo de clúster para evaluar el impacto de una metodología de formación similar a la del PRIOAM en centros socio-sanitarios, cuyas conclusiones nos permitirán planificar nuevas intervenciones.
Hemos puesto en marcha un Programa de prevención, diagnóstico y tratamiento precoz de las infecciones graves, mediante una aproximación multidisciplinar de nuestro grupo (infectólogos, microbiólogos, farmacéuticos), para evaluar la efectividad, en resultados en salud y ecológicos, desarrollando y evaluando algoritmos diagnósticos para las infecciones más graves y frecuentes, y analizar el impacto clínico y pronóstico de programas de optimización del diagnóstico microbiológico (PRODIM). En ello se encuadra el diagnóstico rápido de las infecciones endovasculares graves, mediante nanopore sequencing, con el objetivo de evaluar su utilidad para el diagnóstico etiológico, como requisito esencial para el tratamiento adecuado y la curación.
Joint Action antimicrobial Resistance and Healthcare-Associated Infections
- Desarrollo de herramientas computacionales en el tratamiento de las infecciones por bacterias multirresistentes
En esta línea se realizan proyectos para determinar factores susceptibles de intervenciones dirigidas a reducir la mortalidad o la creación de una plataforma integrada de datos clínicos y genómicos interoperables. Aplicación de machine learning para el diagnóstico y tratamiento precoz de sepsis y shock séptico por microorganismos multirresistentes, igualmente, se trabaja en la identificación de marcadores genéticos asociados a la virulencia bacteriana en cepas aisladas de entornos clínicos.
- Análisis, desde la perspectiva de Una Salud, de infecciones comunitarias causadas por el Virus del Nilo Occidental (VNO)
Esta línea tiene como objetivos generar conocimientos útiles para la prevención, el diagnóstico y el pronóstico de la infección y enfermedad por el VNO que se ha convertido en una infección emergente en nuestro medio. Está orientada a resolver las principales incertidumbres relacionados con los vectores, la magnitud de la infección durante los brotes para detectar los casos asintomáticos y diagnosticar los casos leves, identificar los factores que propician la progresión, especialmente la afectación del sistema nervioso central y la mortalidad, y evaluar la respuesta inmune.
En esta línea, hemos liderado un trabajo donde describimos las características clínicas y pronósticas de la infección por VNO en un estudio retrospectivo multicéntrico de pacientes diagnosticados con infección por VNO durante los brotes de 2020 y 2024 (Caro-Leiro A, [...], Cisneros JM (CA). J Infect Public Health. 2026; 19(3):103072. DOI: 10.1016/j.jiph.2025.103072).
Además, hemos participado, junto con el grupo de Miguel Martín Acebes (INIA-CSIC), en el desarrollo de biosensores para el VNO en los que la actividad enzimática de la proteasa viral, expresada durante la infección, permite su detección mediante técnicas basadas en la fluorescencia (Blázquez AB, [...], Cisneros JM, Martin-Acebes MA, Jiménez de Oya N. Virulence. 2025; 16(1):2597663. DOI: 10.1080/21505594.2025.2597663).
Por otro lado, también hemos contribuido a la caracterización de las alteraciones dinámicas en el lipidoma que definen huellas metabólicas específicas de las diferentes etapas de la infección por VNO, poniendo de manifiesto que la desregulación del metabolismo de los esfingolípidos por el VNO puede ofrecer nuevas oportunidades terapéuticas y respalda el potencial de ciertos lípidos como nuevos biomarcadores periféricos de la progresión de la enfermedad por VNO (Mingo-Casas P, [...], Cisneros JM, Saiz JC, Martín-Acebes MA. Emerg Microbes Infect. 2023 Dec;12(2):2231556. DOI: 10.1080/22221751.2023.2231556).
